（一）办公室。负责机关日常工作；负责主任办公会、干部职工大会、各类专题会等会议的筹备、组织、协调工作；负责撰写年度工作计划（总结）等文件；负责日常文电处理、机要、保密、档案、文印、财务、国有资产管理、后勤服务等工作；负责年度工作目标管理的编制、分解和下达；承担对外联络和接待工作；承担组织干部学习培训、外出考察工作；承担领导交办的其他工作。
（二）综合文稿处（改革综合处）。负责关于经济社会发展、全面深化改革等方面综合性文稿起草、修改、把关工作；负责各类综合性课题及调研计划的方案拟定、组织实施、成果形成等工作；负责对经济社会、改革发展等全局性、综合性、战略性问题进行跟踪分析和政策研究；负责研究处理重大事项及相关请示；承担领导交办的其他工作。
（三）调研一处。负责对经济发展、国资国企、科技创新、生态文明建设等方面重大改革发展问题开展调查研究，撰写研究报告；负责对中央和省、市重大决策部署贯彻落实情况及领导关注的相关重要问题开展调研活动；负责对口领域调研计划拟定、统筹协调和组织实施；承担或参与市委交办的有关文件、文稿的起草和修改；承担领导交办的其他工作。
（四）调研二处。负责对农业农村、党的建设、民主法治建设等方面重大改革发展问题开展调查研究，撰写研究报告；负责对中央和省、市重大决策部署贯彻落实情况及领导关注的相关重要问题开展调研活动；负责对口领域调研计划拟定、统筹协调和组织实施；承担或参与市委交办的有关文件、文稿的起草和修改；承担领导交办的其他工作。
（五）调研三处。负责对社会建设、社会治理、城市管理等方面重大改革发展问题开展调查研究，撰写研究报告；负责对中央和省、市重大决策部署贯彻落实情况及领导关注的相关重要问题开展调研活动；负责对口领域调研计划拟定、统筹协调和组织实施；承担或参与市委交办的有关文件、文稿的起草和修改；承担领导交办的其他工作。
（六）宣传信息处。负责对外宣传工作；负责市内外重大政策、重要信息的收集整理、调研分析、反馈报送，编印《政策动态》《改革信息》；负责信息化建设和应用的组织、协调、管理工作；承担或参与各类法规、规章、规范性文件起草工作；承担领导交办的其他工作。
（七）改革秘书处。负责市委全面深化改革委员会办公室日常工作；负责制定市委全面深化改革委员会中长期规划建议和年度工作要点、台账任务；负责市委全面深化改革委员会会议、改革办主任暨联络员会、改革专题会的组织筹备、文稿起草、会议纪要等工作；参与起草或修改市委有关改革工作的重要文稿；承担与改革专项小组、各县（市）区改革办的对接联络工作；承担领导交办的其他工作。
（八）改革督查处。负责对贯彻落实中央、省委、市委重大政策执行情况和全面深化改革决策部署、年度改革目标任务进行督促检查；负责领导重要批示、交办有关事项、上级督查任务等相关事项的督办落实，起草有关督查报告及整改落实、跟踪问效情况；负责年度改革工作目标责任书制定、考核评估工作；承担上级改革办在昆开展督查的服务协调工作，承担领导交办的其他工作。
（九）机关党总支（人事处）。负责机关党的建设工作；负责机关人事、离退休人员的服务和管理工作；领导机关工、青、妇等工作。
（十）昆明市改革发展研究中心。承担全市经济社会发展重大问题的理论与实践研究；承担全市全面深化改革的基础性、全局性和前瞻性研究；负责开展与国内外高层智库、大学、科研院所的合作协作；承担新型智库日常职能及协调服务工作；举办专题论坛、研讨会、讨论会，多渠道、多形式向外推广昆明经验；完成上级交办的其他工作。
